关于同性恋，韩文琦在《今夜不寂寞》中，整整讲了5个月，共计40期节目。
韩文琦至今还记得他调查的第一例同性恋者是怎么来的。“在一次直播中，一个男子打电话给我，说他是一个同性恋者，他的同性恋经历从14岁开始，当时一个同性恋者引诱他进行了有生以来的第一次性行为，从此他便像上了瘾一般，对同性恋欲罢不能，但是当他理智时又会痛苦不已。因为他想过正常男人的生活，可是他又控制不了自己的性倾向。这时候，我又在想，倘若学校早早地开展性知识、性道德方面的教育，倘若他的父母都深知性教育的重要性，他还会有这么多的痛苦吗？”
“在绝大多数中国人那里，性好像还是一个负面的、必须藏起来的东西。”韩文琦告诉记者，“尽管有并将继续有一些社会环境对某些环境下的同性恋行为持宽容态度，但在大多数的社会环境中，同性恋行为被广泛认为是非自然的、异常的、邪恶的和有罪的行为。大多数生活在现实环境中的同性恋者是压抑又痛苦的，甚至没有人能够倾听他(她)们倾诉，也没有人能对他(她)们的行为给予理解，他(她)们大多生存于隐秘状态下。在我接到他(她)们打来的电话里或是寄来的信件中，我能很直接地感受到那种渴望交流渴望理解愿望的迫切与强烈。”
韩文琦很认真地说：“同性恋并不是人性不健康的一面，在并未伤害别人的前提下，社会对他们还是应该容忍和接纳。我始终认为性教育的早期介入对提高整个民族的素质是有积极意义的。如果不对孩子进行性道德教育，就像交给他们一把锋利的刀，却没有告诉他们去如何合理地使用，这是相当危险的。”
公开讲性：走进高校大声谈性
2000年9月29日晚10点整，为迎接《今夜不寂寞》开播两周年要进行现场直播。内蒙古科技大学师范学院7楼科技讲座厅内，能容纳700人的大教室里挤满了学生，连走廊和后场也都是人，韩文琦回忆，当时据说整整来了一千人。学生们期待着今晚的主角———《今夜不寂寞》主持人大东和客座嘉宾韩文琦的出场。那晚每个人心底都混杂着复杂的情绪，因为他们要共同面对的是一个曾被视为禁区的主题———性。
“教室很大，两个小时我基本上是吼完的。当我回到家里时，我对妻子说：‘教学生们公开谈性，并不像隐匿在电波之中办讲座，紧张并兴奋着’。”其实对于韩文琦而言，无论和学生们一起公开谈性，还是在《今夜不寂寞》中做客座嘉宾，不同的可能仅仅只是心态。这也是韩文琦迄今为止，惟一一次直接面对自己的听众。
“其实，那天大家都为我捏着一把汗，因为和学生谈这个话题，既不能说教，又不能导向错误，挺难的，但那天晚上在现场直播完后我感觉自己把握得还不错。”韩文琦回忆道，“特别让我感到欣慰的是，开始我们还担心没人提问。但是最后老师递过来厚厚一叠纸条，从内容上能看出绝大多数同学都是非常真诚的。”韩文琦说，“我们经历的性蒙昧时间太长了，许多人还不了解自己的性器官，甚至视追求性快感为罪恶，性爱的乐趣也许很多人一辈子都无法体会得到。对于我们这一代人，现在开始接受教育还不算晚，至少可以有助于我们形成正常的性心理，以便更好地影响下一代人，把我们的所知传给下一代，以免让他们重蹈覆辙。”
公开讲性：把青春期性教育放在阳光下
“青春期性教育太薄弱，应该有一个人出来呼吁了”，这或许是韩文琦公开谈性的主要原因。韩文琦认为造成一些学生过早发生性行为并由此造成不良后果的原因很大程度是因为青少年性教育的缺乏，也正因为如此，韩文琦公开谈性才有了它存在的理由与空间。
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